Зафиксировать возврат от убыточности к прибыли предприятиям отрасли удалось за счет масштабной оптимизации затрат. Особенно кардинально оптимизация была произведена в крупных и средних научно-технических организациях. За 2016 год расходная часть бюджетов крупных и средних предприятий уменьшилась практически вдвое, с 3,2 триллиона тенге до 1,8 триллиона тенге. Малые предприятия сектора за этот же период сократили расходы на 5%, до 1,3 триллиона тенге. Оптимизация затрат — ответная мера предприятий отрасли на замедление роста оказанных услуг. Вклад организаций научной и технической деятельности в экономику страны в 2016 году увеличился всего на 0,5%. В 2015 году рост физического объема оказанных услуг составил 4,7%.

В структуре доходов наибольшее сокращение показала выручка от продаж основных товаров и услуг, за год приток уменьшился на 539 миллиардов тенге, или на 21%. В том числе выручка от продаж на крупных предприятиях сократилась на 439 миллиардов тенге, а малых компаний — на 100 миллиардов тенге. Упали доходы и от финансовой деятельности, в т.ч. поступлений по банковским вкладам, — на 149,5 миллиарда тенге, или на 34% по сравнению с 2015 годом. Единственный источник выручки, приток по которому в 2016 году увеличился, — это прочие доходы, включающие в том числе помощь акционеров. За год приток таких средств вырос на 146 миллиардов тенге, или на 19%. При этом поступления прочих доходов в крупных и средних научных и технических организациях выросли на 91 миллиард тенге, малых — на 56 миллиардов тенге.